圣父圣子圣灵虽是一体的，但却有不同的位格，兹分论之：
一、圣父圣子位格之不同
1．圣子乃有另一位格——耶稣基督乃是与父不同的「另一位」，约翰福音五32、37说：「另有一位给我作见证，我也知道他给我作的见证是真的。……差我来的父也为我作过见证。……」
2．圣父圣子有别，一乃是生父，一乃是被生的——诗二7说：「耶和华曾对我说：『你是我的儿子，我今日生你。』」约翰福音一14、18说：「道成了肉身，……正是父独生子的荣光。……从来没有人看见上帝，只有在父怀里的独生子将他表明出来」，三16说：「上帝爱世人，甚至将他的独生子赐给他们」。
3．圣父圣子有别，一是差遣者，一是被差的——约一○36说：「父所分别为圣，又差到世间来的，他自称是上帝的儿子，你们还向他说『你说僭妄的话』吗？」加四4说：「及至时候满足，上帝就差遣他的儿子，为女子所生」。
二、圣父圣子和圣灵不同
1．圣子（耶稣基督）乃和圣父与圣灵不同——约翰福音一四16－17说：「我要求父，父就另外赐给你们一位保惠师，叫他永远与你们同在，就是真理的圣灵」。圣灵的工作，乃是要启示真理，应用真理；尤其要晓谕世人，使他们知道主耶稣就是真理。主耶稣原来就是保惠师，所以说要另外赐一位保惠师。主耶稣是有位格的，所以圣灵也是有位格的。
2．圣灵乃是从圣父出来——约翰福音一五26说：「我要从父那里差保惠师来，就是从父出来真理的圣灵；他来了，就要为我作见证。」
3．圣灵乃是圣父圣子所差来的——约翰福音一四26说：「保惠师，就是父因我的名所要差来的圣灵，他要将一切的事指教你们，……」加四6说：「神就差他儿子的灵进入你们的心，呼叫：『阿爸！父！』」希腊教会误以为圣灵乃仅从父而来，殊不知圣灵乃是圣父因圣子耶稣的名而差来的（约一四26）。莫白莱氏（Mober1y）说，圣灵不是三位一体之中抽象的一位，而是藉着他的奇工，使道成肉身的主耶稣基督的灵活在千千万万的人类心灵里面，而彰显真正的人性来，使人「心志改换一新」、「穿上新人」。「是照着上帝的形像造的，有真理的仁义和圣洁。」（弗四23－24）
三、圣灵也是有位格的
1．他乃有位格的名称——（a）他有男性的代名词：约翰福音一六14说：「他要荣耀我」。权威学者如蒂欣陶夫（Tichendorf）等认为允乃为男性代名词。（b)一词，不能仅译为「保惠师」；此词乃有保惠师、教师、保护者、引导者、中保、辩护者的意思，凡此都是有位格的，决非一种抽象的影响。约翰壹书第二章第一节中之一词，诚如上述，非仅为「保惠师」，乃有以上所举辩护者……等的意思。耶和华虽然说「母亲怎样安慰儿子，我就照样安慰你们」（赛六六13）；但是他也为我们的灵魂要求呼吁，「用说不出来的叹息替我们祷告」（参罗八26）。从以上各种名词和名称而看，圣灵决不是抽象的，而乃有位格的。
2．他与圣父圣子并称──他既与圣父圣子并称，倘使圣父圣子有位格，圣灵当必有位格，兹分论之：（a）他与基督并称：约翰福音一六14主耶稣说：「他（圣灵）要荣耀我；因为他要将受于我的，告诉你们。」（b）他父子并称：马大福音二八19说：「奉父子圣灵的名，给他们施浸。」林后一三13说：「愿主耶稣基督的恩惠，上帝的慈爱，圣灵的感动，常与你们众人同在。」犹大书20－21说：「在圣灵里祷告，保守自己常在上帝的爱中，仰望我们主耶稣基督的怜悯，直到永生。」彼前一2说：「照父上帝的先见被拣选，藉着圣灵得成圣洁，以致顺服耶稣基督，又蒙他血所洒的人。……」
3．他所作与身分相称──他察验、知道、说话、见证、启示、命令、抗拒、感动、帮助、引导、创造、重造、成圣、感化、代祷、督导教会圣工、使人悔悟、施行神迹、死人复活凡此种种，必非仅为一种抽象的力量或影响，必是出于有位格的上帝。创世记第一章第二节说：「上帝的灵运行在水面上」，施展其创造的奇功，六3说：「耶和华说：『人既属乎血气，我的灵就不永远住在他里面』」。路加福音一二12说：「正在那时候，圣灵要指教你们当说的话。」约三8说：「凡从圣灵生的，也是如此。」约一六8说：「他（圣灵）既来了，就要叫世人为罪、为义、为审判，自己责备自己。」使徒行传二4说：「……按着圣灵所赐的口才说起别国的话来」，八29说：「圣灵对腓利说：『你去！贴近那车』」，一○19－20说：「圣灵向他（彼得）说：『有三个人来找你。起来！下去，和他们同往，……因为是我差他们来的。』」一三2说：「圣灵说：『要为我分派巴拿巴和扫罗，去作我召他们所作的工。』」一六6－7说：「圣灵既然禁止他们在亚西亚讲道，……他们想要往庇推尼去，耶稣的灵却不许。」罗八11说：「……必藉着住在你们心里的圣灵，使你们必死的身体又活过来。」八26说：「我们的软弱有圣灵帮助，……圣灵亲自用说不出来的叹息替我们祷告。」一五13、18说：「藉着圣灵的能力，大有盼望。……用神迹奇事的能力，并圣灵的能力，使外邦人顺服」；林前二10－11说：「圣灵参透万事，……除了上帝的灵，没有人知道上帝的事。」一二8－11说：「蒙圣灵赐他智慧的言语；……赐他信心；……赐他医病的恩赐；……一切都是这位圣灵所运行，随己意分给各人」。此处「随己意」一语，乃足证明圣灵的位格（语本Meyer），彼前一2说：「藉着圣灵得成圣洁」；彼后一21说：「人被圣灵感动，说出上帝的话来。」
4．他能感受人的作为——人的作为，对圣灵的抗拒与亵渎往往使圣灵担忧、伤痛，这又证他乃是有位格的。主耶稣说：「人一切的罪和亵渎的话，都可得赦免；惟独亵渎圣灵，总不得赦免。」（太一二31）倘使圣灵仅仅是一种抽象的神的属性，或一种影响，则无从得到感受，人的作为，好像向空气斗拳，这尤可证圣灵必有位格。赛六三10说：「他们竟悖逆，使主的圣灵担忧！……」使徒行传五3－4、9说：「你欺哄圣灵，……你不是欺哄人，是欺哄上帝了。」……「你们为什么同心试探主的灵呢？」七51说：「你们这硬着颈项，……的人，常时抗拒圣灵！」弗四30说：「不要叫上帝的圣灵担忧。」亵渎圣灵，乃如同亵渎自己的母亲，这可以想像圣灵的本性，乃有丰富的情感。所以保罗在罗马书一五30特别提到「藉着圣灵的爱」；又在同书八26说：「圣灵亲自用说不出来的叹息替我们祷告」，此可显明圣灵的心意，及其对我们世人的罪恶与需要关怀之深切，及其无限的圣爱。这又可证圣灵是有位格的。
5．他藉形体表现出来——圣灵并且藉着形体，向世人表现，使人可以看到他；他虽与圣父圣子有别，但和他们的作为乃是直接相关的。马太福音三16－17说：「耶稣受了浸，随即从水里上来。天忽然为他开了，他就看见上帝的灵，仿佛鸽子降下，落在他身上。从天上有声音说：『这是我的爱子，我所喜悦的。』」路加福音三21－22说：「……耶稣也受了浸。正祷告的时候，天就开了，圣灵降临在他身上，形状仿佛鸽子；又有声音从天上来，说：『你是我的爱子，我喜悦你。』」这是主耶稣的祷告，以及天父悦纳的声音，以及圣灵有形有体的降下来，膏圣子做他的圣工。